jardin des plantes

Fiche E3S

Nom du projet

E3S

 

Titre descriptif du projet

Ecologie, Evolution, Ecosystèmes Souterrains (E3S)

 

Partenaire(s)

- UMR 5023 LEHNA, Laboratoire d’Ecologie des Hydrosystèmes Naturels Anthropisés, Equipe « Ecologie, Evolution, Ecosystèmes Souterrains » (CNRS - Université Claude Bernard-Lyon I)
- USR 6402 CC-IN2P3, Centre de calcul de l’Institut national de physique nucléaire et de physique des particules (CNRS)

 

Calendrier de réalisation

- 2015 : Modèle de données V1.0
- 2016 : Modèle de données V2.0. Définition de l’interface
- 2017 : Migration des données et développement d’une interface web de gestion de la base de données

 

Résumé du projet

L’objectif principal est de faciliter le suivi des prélèvements d’amphipodes, isopodes, oligochètes et ostracodes effectués dans des stations de collectes, réparties dans le monde entier, à la fois pour la gestion des données d’occurrences et pour l’analyse moléculaire de ces espèces.
Conception et réalisation d’une base de données permettant :
• d’optimiser les temps de saisies et de traitement des données ;
• d’aider à la gestion des données d’occurrence, des échantillons issus des spécimens « recherche » (lames, tubes …) ;
• de connecter des données d’analyses de séquences et bibliographiques,
• de rendre accessible, de valoriser et de sécuriser les données.

 

Intervention de BBEES dans le projet

- Définition des besoins et modélisation de la base de données
- Réalisation et déploiement d’une base de données PostgreSQL (env. 20 tables et env. 100 champs)
- Définition et réalisation d’une interface web de gestion de la base de données et d’outils d’insertion de jeux de données

 

Personnel BBEES impliqué dans le projet
Date de mise à jour de la fiche